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Utilizzando il nuovo criterio di informazione Akaike marginale (mAIC), questo studio dimostra che i modelli di miscela superano universalmente i modelli partizionati nell'analisi filogenetica dei dati amminoacidici, fornendo un metodo per confrontarli direttamente e suggerendo che lo sviluppo futuro dovrebbe concentrarsi sui modelli di miscela.
Questo studio dimostra che negli insetti cimici il nuovo organo femminile chiamato mesospermalege assume funzioni riproduttive chiave, mentre la risposta trascrizionale post-accoppiamento nel tratto riproduttivo è ritardata e si attiva solo con l'arrivo degli spermatozoi, evidenziando una distinzione evolutiva tra i processi di accoppiamento e quelli di fecondazione.
Lo studio dimostra che il dominio cis-regolatorio interallelico, mediato da hub trascrizionali e trans-azione, maschera varianti che riducono l'espressione genica, permettendo così l'evoluzione di nuovi percorsi mutazionali mantenendo la robustezza dell'output trascrizionale essenziale.
L'analisi genomica dell'esperimento di evoluzione a lungo termine di Lenski rivela che i geni legati alla crescita evolvono precocemente con tassi elevati, mentre quelli legati alla sopravvivenza si adattano successivamente, suggerendo che il ritorno decrescente sui guadagni di fitness in un ambiente stabile guidi il rallentamento dell'evoluzione e favorisca la stasi evolutiva.
Uno studio sperimentale su *Asellus aquaticus* dimostra che, sebbene i tratti funzionali classici come la massa corporea e il tasso metabolico non mostrino un'evoluzione divergente significativa sotto l'effetto combinato di riscaldamento e predazione, la funzione dell'ecosistema (il tasso di decomposizione) evolve rapidamente in risposta a queste pressioni ambientali.
Questo studio utilizza un modello guidato da dati sulle interazioni microbiche per dimostrare come la supply di mutazioni, le dimensioni degli effetti e le asimmetrie tra specie possano causare discrepanze tra le previsioni della dinamica adattativa e quelle della genetica di popolazione, specialmente nei casi di coesistenza stabile.
Questo studio dimostra come la variazione locale della dimensione dei gruppi moduli le dinamiche di parentela e la selezione sui tratti sociali legati all'età, rivelando che nei gruppi più piccoli la parentela cambia più rapidamente, favorendo comportamenti di aiuto o danno più estremi e anticipando fenomeni come la menopausa e l'aiuto post-riproduttivo.
Questo studio dimostra che i pesci spinare di acqua dolce hanno rapidamente e ripetutamente evoluto un'espansione del numero di copie del cluster genico MYH3C, un adattamento che aumenta l'espressione muscolare e persiste nonostante il flusso genico, identificando le varianti del numero di copie come hotspot di evoluzione adattativa ripetuta.
Questo studio caratterizza i profili trascrizionali divergenti dei funghi endofiti *Gaeumannomyces hyphopodioides* e patogeni *G. tritici* durante la colonizzazione precoce delle radici di frumento, rivelando come le differenze nell'espressione genica, inclusa una risposta allo stress specifica e la modulazione degli enzimi degradativi, sottendano i loro stili di vita distinti e l'interazione con l'ospite.
Lo studio analizza i dati genomici di tre specie arboree boreali in Svezia, rivelando come zone di contatto secondarie allineate a gradienti ambientali e diverse modalità di adattamento locale (da loci distribuiti a inversioni cromosomiche) modellino congiuntamente la struttura genetica e il flusso genico in risposta alla ricolonizzazione post-glaciale.
Questo studio presenta una mappa continentale della diversità genomica di 46 specie di rane nel Nord America orientale, rivelando che oltre la metà di esse mostra un gradiente latitudinale di diversità e fornendo un quadro generale per identificare le aree prioritarie per la conservazione.
Lo studio dimostra che il trasferimento orizzontale dei plasmidi accelera la segregazione degli alleli nelle popolazioni eteroplasmiche, favorendo la comparsa di ospiti omoplasmici e rappresentando un meccanismo evolutivo precedentemente non riconosciuto per gli elementi genetici mobili.
Questo studio dimostra che antichi elementi trasponibili, piuttosto che le varianti SNP, sostengono l'adattamento ecologico globale di *Spirodela polyrhiza* nonostante la sua cronicamente bassa diversità nucleotidica, risolvendo così un paradosso evolutivo.
Questo studio applica un nuovo metodo basato esclusivamente sui dati di polimorfismo per stimare i coefficienti di selezione sulle mutazioni sinonime in *Drosophila melanogaster*, rivelando una debole ma significativa pressione selettiva che influenza l'uso dei codoni, la struttura dell'mRNA e la frequenza degli alleli, validando così un approccio coerente per comprendere l'evoluzione dei siti sinonimi.
Questo studio presenta un modello teorico basato su una "scala della cooperazione" in cui la crescita della popolazione e le soglie di ricompensa creano un ciclo di feedback che spiega le espansioni storiche della cooperazione, i periodi di stallo e la persistenza del comportamento egoistico all'interno dei gruppi sociali.
Questo studio presenta un nuovo metodo di inferenza basato sulla simulazione (ABC) per stimare simultaneamente la forza della selezione e il numero di loci selezionati in una popolazione in evoluzione, superando le sfide poste dalle statistiche riassuntive ad alta dimensionalità e dalla correlazione spaziale genomica.
Lo studio identifica negli Asgard archaea una classe di trasportatori di fosfolipidi, StarAsg1, strutturalmente e funzionalmente simili alle proteine di trasferimento lipidico eucariotiche, suggerendo che tali meccanismi fossero già presenti negli antenati degli eucarioti e abbiano facilitato l'evoluzione degli organelli intracellulari.
Questo studio integra analisi bioinformatiche e modelli strutturali per dimostrare che la tireoglobulina, evolutasi da un precursore nidogeno-like attraverso duplicazioni e riarrangiamenti genetici, mantiene una complessità strutturale e funzionale altamente conservata in tutti i vertebrati, a partire dalle lamprede.
Lo studio dimostra che la diversità delle fibre caudali del carotovoricina, un batteriocino simile a un fago presente nel genere *Pectobacterium*, è mantenuta attraverso una ricombinazione omologa su scala genérica che ne permette lo scambio, influenzando così le dinamiche delle comunità batteriche nelle piante infette.
Il paper presenta pylifemap, un pacchetto Python che permette di visualizzare e sovrapporre dati biologici su un albero della vita interattivo, facilitando l'analisi e la condivisione di informazioni tassonomiche in ambiti come la genomica comparativa e il metagenomica.